Броят на служителите в агенцията няма да се променя, като се предвижда вътрешно преструктуриране. Числеността на централна администрация се увеличава за сметка на числеността на специализираните звена.

Дирекция „Пътна безопасност и планиране на дейностите по републиканската пътна мрежа“ ще планира мерки за подобряване на състоянието на съществуващата и изграждането на нова пътна инфраструктура, така че да се предотвратяват пътнотранспортните произшествия в страната. Дирекцията ще трябва да идентифицира приоритетните участъци с концентрация на пътни транспортни произшествия.

Другата нова дирекция „Информационни технологии и системи“ ще отговаря за стратегическото планиране на дейностите в областта на информационните технологии. Дейността на новосъздадената дирекция ще бъде свързана с организирането, координирането и контрола на информационните системи, както и осигуряването на непрекъснато техническо наблюдение и поддръжка на бази данни на агенцията и тяхната работоспособност.

Ще бъде създаден и нов отдел в дирекция „Пътни такси и разрешителни“, който ще осъществява функции по администриране на приходите, постъпили от таксите за ползване на републиканските пътища, и ще поддържа националния електронен регистър на доставчиците на услуги за електронно събиране на такси.